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基于机器学习的虚拟筛选模型构建和PAR4蛋白的同源模建  CNKI文献

机器学习是人工智能(Artificial Intelligence,AI)的一个重要组成部分,可通过计算机模拟人类学习过程以积累经验和技能,并可对所学习到的知识框架进行重新组合以提升其预测性能。机器学习方法已被应用于新药研发的各个...

马威 导师:李洪林 华东理工大学 2021-05-31 硕士论文

关键词: 机器学习 / 虚拟筛选 / 同源模建 / 分子动力学

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钠-葡萄糖转运蛋白2的同源模建研究  CNKI文献

钠-葡萄糖转运蛋白2(SGLT2)是一类介导肾脏葡萄糖重吸收的葡萄糖转运蛋白,其抑制剂可减少葡萄糖的重吸收,促进尿液中葡萄糖的排泄,有效降低血糖水平,被认为是糖尿病治疗的新靶点。目前尚无可用的SGLT2晶体结构,这极大...

姜丽丽 廖和睿... 《上海中医药大学学报》 2021年01期 期刊

关键词: 钠-葡萄糖转运蛋白2 / 非糖苷类抑制剂 / 分子模拟 / 同源模建

下载(79)| 被引(0)

基于计算机辅助药物设计探究扶正避瘟方预防新型冠状病毒感...  CNKI文献

目的从抑制病毒感染不同靶点的选择性、调控机体免疫因子的角度出发,系统研究扶正避瘟方预防新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染的物质基础及分子机制。方法采用计算机辅助药物设计中的同源模建分子对接

靳晓杰 王菲... 《中国中医药信息杂志》 2021年03期 期刊

关键词: 扶正避瘟方 / 计算机辅助药物设计 / 新型冠状病毒 / 同源模建

下载(519)| 被引(1)

吉马烯A合酶的同源模建分子对接  CNKI文献

在吉马烯A合酶的催化作用下,法尼基焦磷酸(farnesyl pyrophosphate,FPP)可生成抗癌药物β-榄香烯.为了提高β-榄香烯的产量,采用分子模拟和对接的方法,分析吉马烯A合酶活性位点的关键氨基酸,以期获得酶活...

霍晋彦 曹洪玉... 《天津师范大学学报(自然科学版)》 2020年06期 期刊

关键词: 吉马烯A合酶 / 同源模建 / 活性位点 / 分子对接

下载(88)| 被引(0)

草菇UBEV2蛋白同源模建筛选其小分子抑制剂  CNKI文献

草菇(Volvariella volvacea)具有典型的低温自溶特征,基于草菇低温自溶与一个泛素结合酶E2(ubiquitin-conjugating enzyme, UBE2)高表达及活性相关,采用虚拟筛选法获得潜在的草菇UBEV2抑制剂小分子化合物。结果...

万佳宁 尚俊军... 《食用菌学报》 2020年04期 期刊

关键词: 草菇 / 泛素结合酶E2 / 虚拟筛选 / 抗冻保鲜

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采用分子对接技术发现抗冠状病毒肺炎药物的研究  CNKI文献

新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19),简称"新冠肺炎",是一种由病毒引起的急性呼吸道传染性疾病。当前全球新型冠状病毒COVID-19形式依然十分严峻。随着科研工作者们坚持不懈的研究,COVI...

罗菁汉 吴成军... 第十七届沈阳科学学术年会论文集 2020-09-08 12:16 中国会议

关键词: COVID-19 / 计算化学 / 同源模建 / 分子对接

下载(934)| 被引(1)

人酪氨酸酶的同源模建研究  CNKI文献

酪氨酸酶是皮肤黑色素生物合成过程中的限速酶,其抑制剂作为皮肤脱色剂具有重要的商业价值.目前尚无可用的人酪氨酸酶晶体结构,极大地限制了人酪氨酸酶抑制剂的研究.以人酪氨酸酶相关蛋白-1的晶体结构为模板,利用

周游 王远强... 《西南大学学报(自然科学版)》 2020年08期 期刊

关键词: 人酪氨酸酶 / 人酪氨酸酶相关蛋白-1 / 同源模建 / 分子动力学

下载(121)| 被引(1)

乙酰辅酶A羧化酶抑制剂解离机制和氟噻唑吡乙酮与氧化固醇结...  CNKI文献

乙酰辅酶A羧化酶(Acetyl-CoA carboxylase,ACCase)是重要的除草剂靶标之一。目前靶向ACCase已成功开发了芳氧苯氧丙酸酯(Aryloxyphenoxypropionates,APP)、环己二酮(Cyclohexanediones,CHD)和唑啉草酯(Phenylpyrazoli...

高梦琪 导师:朱晓磊 华中师范大学 2020-05-01 硕士论文

关键词: 乙酰辅酶A羧化酶 / 分子动力学 / 拉伸动力学 / 氟噻唑吡乙酮

下载(100)| 被引(0)

G偶联蛋白受体142活性位点预测及其与激动剂对接研究  CNKI文献

G偶联蛋白受体142(GPR142)主要在胰岛B细胞中表达,可通过内源性配体色氨酸或合成的GPR142激动剂来调节胰岛素分泌而治疗糖尿病,是重要靶点蛋白,但因属于膜蛋白,晶体结构难以解析.本实验对GPR142膜蛋白进行同源建...

曹洪玉 于柯楠... 《昆明理工大学学报(自然科学版)》 2020年02期 期刊

关键词: G偶联蛋白受体142 / 同源模建 / 活性位点 / 苯并氧氮杂类衍生物

下载(112)| 被引(0)

VGSC抑制剂的作用机制及虚拟筛选的分子模拟研究  CNKI文献

疼痛是目前医学领域十分普遍且棘手的问题,其中神经性疼痛、炎症性疼痛和临床手术疼痛最为突出。大量临床实验表明,电压门控钠离子通道(钠通道,VGSC)与疼痛的产生和发展有着极为密切的联系,是疼痛治疗的重要靶点。目前...

阎影 导师:李雯 郑州大学 2020-04-01 硕士论文

关键词: 局部麻醉剂 / Nav1.8选择性抑制剂 / 分子动力学模拟 / 同源模建

下载(56)| 被引(0)

靶向木瓜样蛋白酶的抗SARS-CoV-2药物虚拟筛选  CNKI文献

利用与急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)具有高度同源性的人冠状病毒类木瓜蛋白酶(human coronavirus papain-like protease)晶体,对木瓜样蛋白酶(PLpro)进行同源模建,再通过该模建的蛋白对已...

李广平 何清秀... 《重庆理工大学学报(自然科学)》 2020年04期 期刊

关键词: 急性呼吸综合征冠状病毒2型 / 同源模建 / 虚拟筛选 / 分子对接

下载(820)| 被引(2)

他汀类药物对GK大鼠心房肌细胞电生理影响及分子模拟...  CNKI文献

目的:目前糖尿病是全世界上发病率极高的一种疾病,大量研究发现在糖尿病患者中有较高的心血管疾病发生率和死亡率,而且糖尿病患者发生心律失常的比例也逐年增高,以往研究主要专注在室性心律失常,对于房性心律失常的研...

段娜 导师:李晓东 中国医科大学 2020-03-01 博士论文

关键词: 2型糖尿病 / 瑞舒伐他汀 / 钙离子通道 / 线粒体钙单向转运蛋白

下载(85)| 被引(0)

GPR91与激动剂和抑制剂的作用模式及其激活机制研究  CNKI文献

GPR91受体与非酒精性脂肪性肝炎的肝纤维化过程密切相关,是一个潜在的药物治疗靶点。本研究旨在通过计算机辅助药物设计手段研究GPR91受体与其激动剂琥珀酸和抑制剂7e之间的结合模式,阐明其中关键的氨基酸残基,并探究...

赵邦毅 付伟 2019中国化学会第十五届全国计算(机)化学学术会议论文集 2019-11-14 中国会议

关键词: 非酒精性脂肪性肝炎 / GPR91 / 同源模建 / 分子对接

下载(17)| 被引(0)

EPPIN/SEMG1和p62-zz/IDR1的分子模拟及靶向小分子  CNKI文献

蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,简称PPI)是调控生物信号的主要实现方式,对其选择性的干预能够改变细胞的功能及命运。在药物研究中,PPI是区别于酶和受体的新靶点,也是药物研究的新热点。通过计算模拟...

单长宇 导师:陈应春 中国人民解放军陆军军医大学 2019-11-01 硕士论文

关键词: 附睾蛋白酶抑制剂 / 精囊凝固蛋白-1 / p62蛋白 / 天然防御调节因子-1

下载(206)| 被引(0)

入侵害虫松树蜂气味结合蛋白与其相关信息化学物质的分子  CNKI文献

为探究入侵我国的重大林业检疫性害虫松树蜂Sirex noctilio的气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)与其相关信息化学物质的结合模式和结合能力,采用Swiss-model在线服务器对松树蜂触角中高表达的4种OBP序列进行...

郭冰 郝恩华... 《植物保护学报》 2019年05期 期刊

关键词: 松树蜂 / 气味结合蛋白 / 信息素 / 植物挥发物

下载(279)| 被引(6)

同源模建和虚拟筛选木糖葡萄球菌中咪唑甘油磷酸酯脱...  CNKI文献

[目的]咪唑甘油磷酸酯脱水酶(IGPD)是除草剂的治疗靶点,也是木糖葡萄球菌治疗奶牛乳房炎的可能靶点。IGPD的三维结构对于虚拟筛选抑制剂的发现是至关重要的。然而,迄今为止还没有报道木糖葡萄球菌IGPD的三维结构。[方...

陈星儒 王小婷... 中国畜牧兽医学会兽医药理毒理学分会第十五次学术讨论会论文... 2019-10-13 中国会议

关键词: 咪唑甘油磷酸酯脱水酶 / 木糖葡萄球菌 / 同源模建 / 虚拟筛选

下载(45)| 被引(0)

eEF2K蛋白同源模建及其抑制剂小分子的虚拟筛选...  CNKI文献

目的:筛选潜在的真核生物延伸因子2激酶(eEF2K)抑制剂小分子,为eEF2K抑制剂的设计和研发提供参考。方法:采用同源模建技术构建eEF2K蛋白晶体结构模型,并进行Loop优化和分子动力学优化,借助SAVES在线...

黎玉梅 孔研... 《中国药房》 2019年16期 期刊

关键词: 真核延伸因子2激酶 / 抑制剂小分子 / 同源模建 / Hypogen药效团

下载(353)| 被引(3)

定向进化CYP105D1酶提高l-THP转化活性研究  CNKI文献

细胞色素CYP105D1是Streptomyces griseus ATCC 13273中生物转化左旋四氢巴马汀合成左旋紫堇达明的关键酶,课题组前期成功在原核体系中克隆了CYP105D1,实现了利用工程菌株生物转化合成制备左旋紫堇达明。但是,CYP105D...

欧晨辉 沈辰... 《药物生物技术》 2019年04期 期刊

关键词: CYP105D1 / 左旋四氢巴马汀 / 左旋紫堇达明 / 同源模建

下载(171)| 被引(1)

基于转酮醇酶为靶标的除草活性分子筛选及其除草活性...  CNKI文献

为发现新颖结构的转酮醇酶抑制剂,本研究采用swiss-MODE同源模建拟南芥的转酮醇酶蛋白模型,并运用分子对接技术进行虚拟筛选。基于转酮醇酶与小分子相互作用的预测值,筛选并购买SPECS数据库中的16个...

高卫 李晓天... 《河北农业大学学报》 2019年04期 期刊

关键词: 转酮醇酶 / 同源模建 / 分子对接 / 除草活性

下载(93)| 被引(2)

木糖葡葡球菌对泰乐菌素和氟苯尼考交叉耐药机制的研究  CNKI文献

奶牛乳房炎是奶牛的主要疾病之一,对全世界的奶牛养殖业以及乳制品行业造成巨大的经济损失。引起奶牛乳房炎的病原除了常见的金黄色葡萄球菌、无乳链球菌、大肠杆菌等以外,凝固酶阴性葡萄球菌引起的感染呈上升趋势,已...

刘鑫 导师:李艳华 东北农业大学 2019-06-01 博士论文

关键词: 木糖葡萄球菌 / 泰乐菌素 / 氟苯尼考 / 交叉耐药机制

下载(244)| 被引(3)

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