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蛋白质分子分类及三维建模研究  CNKI文献

蛋白质分类问题是蛋白质科学研究中的一个重要部分,近年来引起了广大学者地关注。为了全面揭示蛋白质的组成结构以及相关功能,对蛋白质分类问题的研究就成为了很重要的研究课题,并且蛋白质分类问题在生物物理学的理论...

孙素平 导师:史小红 西安工业大学 2018-05-07 硕士论文

关键词: 蛋白质分子 / 蛋白质结构分类 / 小波变换 / 结构相似性分析

下载(317)| 被引(2)

蛋白质结晶倾向性与溶液结构测定可行性的生物信息学预测  CNKI文献

解析蛋白质的三维结构可促进生命科学各个领域的研究,例如蛋白质功能研究,药物筛选和设计,人类健康和疾病,以及蛋白质理性设计,等等。为此,结构基因组学拟采用高通量X-射线晶体学和NMR谱学等方法解析生物学功能重要的...

王辉林 导师:林东海 厦门大学 2017-12-01 博士论文

关键词: 蛋白质结构测定 / 蛋白质晶体学 / NMR结构测定 / 生物信息学预测

下载(159)| 被引(1)

基于序列特征组合与核非线性回归预测蛋白质折叠速率  CNKI文献

选取可压缩性、LZ复杂度等特征值,将它们和20种氨基酸属性C_a,K~0,P_β,R_a,ΔASA,PI,H_t,M_μ,Esm进行组合,表征蛋白质序列.建立多元核非线性回归模型,用核非线性回归模型计算了83个蛋白质的折叠速...

王雅男 白凤兰... 《大连交通大学学报》 2017年04期 期刊

关键词: 核非线性回归 / 特征组合 / 蛋白质序列 / 相关系数

下载(87)| 被引(1)

基于序列特征组合与核非线性回归预测蛋白质折叠速率  CNKI文献

蛋白质是一类重要的生物大分子,是生命活动的主要承担者,也是构成细胞的基本有机物。蛋白质可凭借相互作用在特定的酸碱度、温度等环境下自己组装自己,获得其功能性结构和构象的过程称为蛋白质折叠。而蛋白质折叠速率...

王雅男 导师:白凤兰 大连交通大学 2017-06-19 硕士论文

关键词: 氨基酸 / 序列特征值 / 核非线性回归 / 相关系数

下载(55)| 被引(0)

蛋白质编码序列特征值对蛋白质折叠速率的影...  CNKI文献

蛋白质折叠对蛋白质的功能起着重要作用。只有蛋白质折叠成为正确的天然结构,才能完成蛋白质的功能。蛋白质正常的折叠能使生物的各项机能正常的运行。如果蛋白质进行了错误的折叠,就会使生物体的机能改变,以至于会导...

李欣颖 导师:白凤兰 大连交通大学 2015-06-30 硕士论文

关键词: 蛋白质折叠速率 / 氨基酸 / 多元线性回归 / Jackknife方法检验

下载(85)| 被引(1)

蛋白质序列的混合特征值对折叠速率的影响  CNKI文献

鉴于蛋白质折叠速率预测对研究其蛋白质功能的重要性,许多的科研工作者都开始对影响蛋白质折叠速率的因素进行研究。各种预测参数和方法被提出。利用蛋白质编码序列的不同特征参数,不同的二级结构及不同的折叠类...

李欣颖 白凤兰 《生物信息学》 2014年03期 期刊

关键词: 蛋白质序列 / 特征值 / 折叠速率 / 相关系数

下载(78)| 被引(1)

序列特征值预测酶和非酶蛋白及内含肽  CNKI文献

利用生物信息学快速准确鉴别酶、非酶蛋白及内含肽能极大提高实验效率,而测序数量的指数型增长使酶、非酶蛋白及内含肽的自动分类尤显重要。本文获取了同一性小于25%的序列共计3853条,采用Z标度的伪氨基酸

葛慧华 罗靖... 《计算机与应用化学》 2010年04期 期刊

关键词: / 非酶蛋白 / 内含肽 / 伪氨基酸组成

下载(125)| 被引(1)

基于二级结构氨基酸组成识别酸性、中性及碱性酶  CNKI文献

本研究系统分析了酸性、碱性和中性酶在二级结构氨基酸组成上的差异。结果发现在形成特定二级结构过程中,酸性酶和碱性酶有着不同的氨基酸使用偏向;同时,在酸性和碱性酶中,中性氨基酸和侧链微小的~...

张光亚 高嘉强... 《生物工程学报》 2009年10期 期刊

关键词: 二级结构 / 氨基酸组成 / 酸性酶 / 碱性酶

下载(144)| 被引(4)

基于不同标度伪氨基酸组成预测脂肪酶的类型  CNKI文献

序列出发预测某蛋白质是否为脂肪酶以及属于哪种脂肪酶具有重要的理论和应用价值。提出了基于Z标度和T标度的伪氨基酸组成方法提取序列特征值,采用了k-近邻算法回答上述问题。经参数选择后,三种方...

张光亚 李红春... 《生物工程学报》 2008年11期 期刊

关键词: 脂肪酶 / Z-标度 / T-标度 / 伪氨基酸组成

下载(92)| 被引(2)

基于修正的伪氨基酸组成预测氧化还原酶辅酶类型  CNKI文献

序列出发快速确定氧化还原酶的辅酶依赖类型对于了解其结构和功能、催化机制及构建辅酶再生体系具有重要指导作用。对Chou提出的伪氨基酸组成方法进行了修正并用于提取氧化还原酶序列特征值,采用...

张光亚 李红春... 《生物工程学报》 2008年08期 期刊

关键词: 氧化还原酶 / 辅酶依赖类型 / 修正的伪氨基酸组成 / k-近邻

下载(100)| 被引(3)

基于不同序列特征值预测氧化还原酶辅酶类型的研究  CNKI文献

如何有效提取蛋白质序列特征值,一直是生物信息学研究的重要任务。本文研究8种序列特征值提取方法,并考察它们在不同分类器中的表现,以用于预测氧化还原酶辅酶依赖类型。其中,氨基酸组成法效果最差...

张光亚 葛慧华... 《计算机与应用化学》 2008年05期 期刊

关键词: 特征值提取 / 氧化还原酶 / 辅酶 / 两性伪氨基酸组成

下载(100)| 被引(0)

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