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整合生物信息学分析痤疮的关键基因与免疫浸润水平  CNKI文献

目的 通过整合分析多芯片数据,探究与痤疮发病相关的关键基因及免疫细胞浸润水平。方法 从GEO数据库获取基因芯片数据集,采用“limma” R包和加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与痤疮表型相关~#...

樊文龙 王红心... 《皮肤性病诊疗学杂志》 2022年05期 期刊

关键词: 痤疮 / 关键基因 / 加权基因共表达网络分析 / 免疫浸润

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系统生物学研究揭示脑缺血再灌注损伤发生发展机制  CNKI文献

缺血性脑卒中是一种具有高发病率、高致死率的复杂疾病,尽管已经开展了大量通过调控兴奋性中毒、氧化应激、细胞凋亡、炎症反应等方面进行神经细胞保护的临床干预治疗研究,但一些在模式动物实验中获得较好效果的方案在...

程旭 导师:李红良 武汉大学 2019-05-01 博士论文

关键词: 脑缺血再灌注 / 外显子跨越 / 基因共表达网络 / 配体-受体

下载(85)| 被引(0)

基于基因共表达网络筛选胃癌新的关键基因及CO...  CNKI文献

在全球范围内胃癌是常见的消化道恶性肿瘤之一,其发病率与死亡率分别居于所有恶性肿瘤中的第5位和第3位。我国更是胃癌的高发地区,其发病率和死亡率远高于全球平均水平。由于早期症状不典型,多数患者确诊时已处于肿瘤...

陈健 导师:王秀问 山东大学 2019-03-10 博士论文

关键词: 胃癌 / 权重基因共表达网络 / COL8A1 / PI3K/AKT信号转导通路

下载(290)| 被引(1)

脑胶质瘤基因调控网络模型研究  CNKI文献

高通量技术产生了海量的生物信息数据,而分析这些数据是系统生物学研究的重点和难点,通常采用聚类算法来寻找具有相似表达模式的基因组,构建基因调控网络,分析基因之间的相互作用...

赵玲 导师:杨春德 重庆邮电大学 2018-06-06 硕士论文

关键词: 脑胶质瘤 / 双聚类算法 / 基因调控网络

下载(52)| 被引(0)

基于生物网络的大鼠再生肝细胞基因表达谱数据...  CNKI文献

哺乳动物肝脏具有极强的再生能力,部分肝切除(partial hepatectomy,PH)后肝脏在一定时期内恢复原来质量和功能的过程,称为肝再生(liver regeneration,LR)。肝功能异常可导致各种肝脏疾病,对患病肝脏进行肝切除或活体肝...

周运 导师:徐存拴 河南师范大学 2016-05-01 博士论文

关键词: 肝再生 / 基因表达谱 / 聚类 / 基因共表达网络

下载(300)| 被引(5)

两类稀疏群Lasso及其在生物信息挖掘中的应用  CNKI文献

稀疏回归模型具有在高维数据上预测和估计未知参数的优点,因此在统计学、机器学习、生物信息学等领域引起了广泛的关注.然而将其应用于复杂疾病和复杂生物过程的生物信息挖掘中时面临着群体基因选择、生物可解释...

王雅娣 导师:李钧涛 河南师范大学 2016-04-01 硕士论文

关键词: 群lasso / 加权基因共表达网络 / 生物信息挖掘 / 微阵列数据分类

下载(182)| 被引(0)

基于系统生物学整合技术挖掘结直肠癌形成中的核心通...  CNKI文献

目的探索结直肠癌(colorectal carcinoma,CRC)形成中的核心通路和关键基因。方法利用meta分析技术从以往5项CRC发生相关转录组学研究中筛选癌及癌旁差异表达基因。采用ComBat方法合并5项研究的癌组织

苗华 曹付傲... 《第二军医大学学报》 2015年06期 期刊

关键词: 结直肠肿瘤 / 核心通路 / 驱动基因 / 计算生物学

下载(231)| 被引(2)

玉米中磷酸肌醇代谢调控网络构建及相关基因功...  CNKI文献

磷酸肌醇是一类广泛存在于植物中的磷脂类化合物,具有重要的生理和生化功能。但是由于缺乏精准可靠的检测方法和系统深入的研究手段,使得人们对于植物磷酸肌醇的代谢和调控所知有限。目前植物中已知的有关磷酸肌...

张少军 导师:范云六 中国农业科学院 2015-03-01 博士论文

关键词: 转录组测序 / 小RNA测序 / 基因共表达网络 / 磷酸肌醇

下载(522)| 被引(5)

基因网络分析的统计模型研究  CNKI文献

细胞的生物功能是通过基因及其产物之间相互作用,形成复杂的调控网络来实现的。理解生命系统基因间的相互作用及其功能是系统生物学研究的核心内容。通过高通量生物技术,我们获取了大...

张相华 导师:冯焕清 中国科学技术大学 2011-05-01 博士论文

关键词: 系统生物学 / 基因共表达网络 / 基因调控网络 / 基因关联网络

下载(1501)| 被引(4)

基于基因表达和蛋白质相互作用数据集成的蛋白质进化...  CNKI文献

蛋白质相互作用在许多细胞过程中扮演着重要的角色,而蛋白质相互作用网络研究则可以从系统层次来理解细胞的活动。探索蛋白质的网络拓扑属性与其生物学功能属性之间的关系是系统生物学...

庞开放 导师:盛焕烨 上海交通大学 2011-02-01 博士论文

关键词: 蛋白质相互作用网络 / 蛋白质进化 / 动态模块化组织 / 基因表达

下载(492)| 被引(1)

权重基因共表达网络分析识别心肌梗死后左室重构的关...  CNKI文献

背景与目的:心肌梗死后的心脏重构是是发生慢性心力衰竭的主要病理基础,其分子机制仍不清楚。经典的差异表达分析方法忽略了基因表达谱的强关联性,不能有效的分析关键调节通路与基因。本课题采用新开发的系统生物学方...

钟诗龙 伍虹... 第十届全国心血管药理学术会议暨2010(重庆)国际心血管疾病... 2010-10-22 国际会议

关键词: 心肌梗死后 / 心脏重构 / 权重基因共表达网络分析 / 左室重构

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