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丝氨酸蛋白酶超家族分子结构进化研究  CNKI文献

采用刚体结构比较法进行蛋白质的结构比较,根据结构比较分数构建分子进化树, 研究丝氨酸蛋白酶超家族分子的进化规律。对分子进化树进行了一些初步分析,得到了一些有意义的结果。根据蛋白质的进化,可以比较精确的...

孙之荣 王钰... 《生物物理学报》 1999年03期 期刊

关键词: 分子进化 / 结构比较 / 进化树 / 丝氨酸蛋白酶超家族

下载(752)| 被引(47)

用人工神经网络方法预测蛋白质超二级结构  CNKI文献

蛋白质超二级结构,即由α-螺旋和β-折叠等二级结构单元和连接短肽组成的超二级结构,是蛋白质结构研究中的一个重要层次。目前蛋白质超二级结构的预测工作尚属摸索阶段,还没有成熟的方法。人工神经网络预测方法是...

孙之荣 饶晓谦 《生物物理学报》 1995年04期 期刊

关键词: 神经网络方法 / 蛋白质 / 超二级结构 / 预测

下载(229)| 被引(21)

α螺旋和β折叠连接短肽的构象分析──蛋白质超二级结构模...  CNKI文献

对240个分辨率在25A以上较高度蛋白质结构中α螺旋和β折叠的连接短肽进行了系统分析。着重研究了一个至五个残基长的短连接肽,依它们所连接的二级结构分成四种类型分析,即αααβ和ββ。对非规则结构区,作...

孙之荣 《生物物理学报》 1994年02期 期刊

关键词: 连接短肽 / α螺旋 / β折叠 / 超二级结构

下载(372)| 被引(5)

蛋白质结构层次中的超二级结构  CNKI文献

近年来关于蛋白质超二级结构(supersecondarymotifs,Motifs)的研究已成为国际上一个热点课题,国内也开始出现有关的研究论文,蛋白质超二级结构是两个或几个规则二级结构单元的进一步组...

孙之荣 《生物化学与生物物理进展》 1995年06期 期刊

关键词: 蛋白质 / 超二级结构 / Motifs特征

下载(316)| 被引(4)

蛋白质中原子与基团的可及性的一种新计算方法及其应用  CNKI文献

实现了一种新的蛋白质中原子层次可及面积的计算方法-Monte-Carlo模拟方法。计算了溶菌酶各个原子与功能基团的可及性,并应用于蛋白质结构和功能的研究中。使得对蛋白质性能的预测更准确,提供了一种对蛋...

孙之荣 郭青 《生物物理学报》 1996年03期 期刊

关键词: 蛋白质 / 可及性 / Monte-carlo模拟 / 原子水平

下载(55)| 被引(13)

蛋白质中较频繁发生的β发夹结构(β—Hairpins)模式──...  CNKI文献

分析了240个分辨率在2.5A以上的高精度蛋白结构,研究了α螺旋和β折叠的连接短肽中的β发夹结构模式。首先对较频繁发生的超二级结构组中的E—loop—E[1](即β回折结构-βTurn)进行了分析,对...

孙之荣 《生物物理学报》 1994年04期 期刊

关键词: 连裂短肽 / α螺旋 / β折叠 / β发夹结构

下载(191)| 被引(4)

蛋白质α螺旋和β折叠连接多肽的分类  CNKI文献

α螺旋和β折叠连接多肽在蛋白结构中起着十分重要的作用。本文对240个分辨率在0.25nm以上较高精度结构的蛋白中α螺旋和β折叠的连接多肽进行了分类研究。在杂乱无序的连接多肽中识别出普遍发生的类型,并对...

孙之荣 《清华大学学报(自然科学版)》 1994年06期 期刊

关键词: 连结多肽 / α螺旋 / β折叠 / 蛋白质

下载(431)| 被引(2)

蛋白质中频繁发生的超二级结构模式  CNKI文献

近年来,高分辨X射线衍射的蛋白构象分析表明,超二级结构的构象类型是有限的.本文对240个分辨率在0.25nm以上的较高精度蛋白结构中的超二级结构进行了系统分析,识别出频繁发生的超二级结构模式.最普遍发生的共11种超二...

孙之荣 《科学通报》 1994年24期 期刊

关键词: 连接短肽 / 超二级结构 / 蛋白质

下载(141)| 被引(4)

蛋白质双向电泳图谱的计算机处理和数量化分析  CNKI文献

本文叙述了通过计算机硬件和软件的方法,对蛋白质的二维电泳图谱进行图像处理和数量化分析的工作.采用计算机图像处理的方法从电泳图谱的斑点图中抽取有用的信息,采用图像分析技术确定电泳图谱蛋白斑点的强度,比较几个...

孙之荣 赵晓鹏... 《生物物理学报》 1989年04期 期刊

关键词: 灰度值 / 图像处理 / 数量化分析

下载(107)| 被引(5)

锌指结构域序列的进化生成模拟——遗传算法在蛋白质结构研...  CNKI文献

遗传算法(Genetic algorithms, GA)是具有高频率的搜索机制的算法.遗传算法不仅为蛋白质结构研究提供了一种全局自适应搜索算法,使能量最低状态(按热力学假说,蛋白质的天然状态的能量最低)的搜索更加方便,而且为我们提...

孙之荣 韩浩 《科学通报》 1997年17期 期刊

关键词: 遗传算法 / 锌指结构域 / 进化模拟 / 蛋白质序列

下载(104)| 被引(4)

蛋白质功能基团的修饰与其生物活力之间的定量关系——计算...  CNKI文献

邹承鲁提出的蛋白质侧链基团的修饰与其生物活性之间的定量关系的统计学方法,已被广泛地应用于判断酶的必需基团的数目和性质。但是这一方法的手工计算作图比较繁琐,还可能造成某些误差。本文作者对邹的这一定量关系进...

孙之荣 赵康源... 《中国科学(B辑 化学 生命科学 地学)》 1992年06期 期刊

关键词: 化学修饰 / 功能基团 / 计算机模拟 / 必需残基

下载(128)| 被引(0)

培养基成份影响水稻花培效率的变量分析和主次因子研究  CNKI文献

以 N_6培养基为基础,培养基各组份用量的多少对培养率的影响,进行了全面的优化试验。1987年变化了20个组份的因素水平。在对87年试验结果进行变量分析和主次因子研究的基础上,又设计了1988年的试验,继续改变了17个组份...

孙之荣 倪丕冲... 《作物学报》 1990年02期 期刊

关键词: 花药培养基 / 变量分析 / 主次因子研究 / 培养率

下载(43)| 被引(3)

遗传算法在蛋白质变异理论研究中的应用  CNKI文献

应用遗传算法对二维网格蛋白质模型进行蛋白质变异的模拟 ,研究了单突变和双突变对蛋白质折叠及结构稳定性的影响 .发现在二维网格蛋白质模型中 ,内核疏水残基被非疏水残基替代的结果导致蛋白质的稳定性降低 (同时随着...

孙之荣 韩浩 《科学通报》 1998年01期 期刊

关键词: 遗传算法 / 二维网格蛋白质模型 / 单突变 / 双突变

下载(46)| 被引(2)

上帝有了竞争者  CNKI文献

自然演化的有机体被生物学家形象地称为"生命1.0版本",在过去几十亿年的地球演化史中,生命的形式都在自然基础上展开,繁衍生息,新陈代谢。

孙之荣 《商务周刊》 2010年01期 期刊

关键词: 合成生物学 / 科学院 / 生物学家 / 生物系统

下载(52)| 被引(0)

用模式识别方法预测膜蛋白RC、BR和RH的二级结构  CNKI文献

膜蛋白的结构预测在目前比较困难.本文利用已建立的模式识别方法预测了三个典型的膜蛋白RC,BR和RH的二级结构,预测结果与实验资料的符合率与该方法用于球蛋白时的结果相仿,是成功的.本文进一步完善了模式识别预测蛋白...

孙之荣 赵卫东... 《生物物理学报》 1993年01期 期刊

关键词: 模式识别法 / 膜蛋白 / 二级结构 / 预测

下载(50)| 被引(1)

用模式识别方法预测蛋白质的二级结构  CNKI文献

本文建立了用模式识别理论和技术在计算机上预测蛋白质二级结构的方法.特征的抽取和样本的选择是使用该方法的关键.这一方法与其他方法相比各有特色,预测精度也比较高,鉴于目前国内外将此方法用于蛋白结构预测的研究的...

孙之荣 赵南明... 《生物物理学报》 1991年04期 期刊

关键词: 二级结构 / 模式识别方法 / 分类器 / 特征量

下载(35)| 被引(1)

利用微型计算机分子图形技术显示铁氧还蛋白的分子结构  CNKI文献

我们利用微型计算机图形技术对两种铁氧还蛋白的分子结构进行了研究,输入蛋白晶体数据,重构出铁氧还蛋白分子的三维结构模型,并可使之统X轴、Y轴和Z轴旋转;计算出肽链上原子之间的健长、健角、(?)角:显示微区结构;进一...

孙之荣 阎隆飞 《生物物理学报》 1990年01期 期刊

关键词: 铁氧还蛋白 / 图形技术 / 分子结构 / 三维结构

下载(41)| 被引(0)

QUANTITATIVE RELATION BETWEEN MODIFICATION OF FUNCTION...  CNKI文献

Based on a statistical treatment of the quantitative relation between the extents of mod-ification of protein functional groups and the decrease of their biological activity, a meth-od was proposed (...

孙之荣 赵康源... 《Science in China,Ser.B》 1992年11期 期刊

关键词: chemical / modification / functional / groups

下载(25)| 被引(0)

Electrostatic Interactions in Protein Molecules:A ...  CNKI文献

ElectrostaticInteractionsinProteinMolecules:ANovelModelfortheCalculationoftheIntrinsicpKaofLysozymeS...

孙之荣 韩浩... 《Tsinghua Science and Technology》 1997年01期 期刊

关键词: protein / accessibility / Monte / Carlo

下载(25)| 被引(0)

粳稻花药培养基优化试验研究  CNKI文献

培养基的筛选研究,是提高花药培养率的关键问题之一。国内外不少研究人员进行了大量工作,取得了一定的进展。我们自1986年开始以 N_6培养基为基础,对培养基的各个组分进行全面的变量分析和主次因子的研究。我们已报道...

孙之荣 倪丕冲... 《Journal of Integrative Plant Biology》 1992年04期 期刊

关键词: 花药培养 / 优化试验 / 粳稻

下载(31)| 被引(0)

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