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蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组  CNKI文献

随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因...

张昆 王乐珩... 《生物化学与生物物理进展》 2013年04期 期刊

关键词: 蛋白质基因组学 / 基因组注释 / 蛋白质组学 / 质谱技术

下载(1861)| 被引(15)

基于电子捕获裂解/电子转运裂解串联质谱技术的蛋白质组学研...  CNKI文献

蛋白质组学的兴起带动了质谱技术的快速发展,而质谱技术的进步则拓宽了蛋白质组学研究问题的广度.最近10年内,肽段或完整蛋白质在质谱仪中的裂解技术——电子捕获裂解(electron capture dissociation,ECD)与电子转运裂...

孙瑞祥 董梦秋... 《生物化学与生物物理进展》 2010年01期 期刊

关键词: 电子捕获裂解 / 电子转运裂解 / 碰撞诱导裂解 / 串联质谱技术

下载(595)| 被引(23)

肽段反相色谱保留时间预测算法及其在蛋白质鉴定中的应用  CNKI文献

液相色谱-质谱(LC-MS)联用是当今规模化蛋白质鉴定的主流技术。肽段在反相液相色谱(RPLC)中的保留时间主要是由肽段的理化性质和LC条件(固定相、流动相)决定的。可以通过分析肽段的理化性质,并量化它们对肽段色谱行为...

刘超 王海鹏... 《色谱》 2010年06期 期刊

关键词: 反相液相色谱-质谱联用 / 保留系数 / 机器学习 / 保留时间

下载(267)| 被引(8)

基于阿里云平台的蛋白质分析软件pFind-Cloud  CNKI文献

随着质谱仪灵敏度、质量精度和数据采集速度的不断提高,质谱鉴定软件也愈加复杂,对计算资源的要求也越来越高,价格高昂的计算设备让许多中小型实验室对高通量蛋白质组学研究望而却步[1,2]。为降低质谱研究的门槛,帮助...

牛秀南 王振振... 第三届全国质谱分析学术报告会摘要集-分会场2:蛋白组学与代... 2017-12-09 中国会议

关键词: 蛋白质组学 / 云计算 / 质谱技术 / 搜索引擎

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pQuant:蛋白质组学定量数据解析软件  CNKI文献

蛋白质定量是蛋白质组学的重要研究内容,而定量数据解析是其中最关键的环节之一。我们开发了相关软件pQuant,主要支持基于一级谱图信息的标记定量实验,如SILAC标记实验、15N标记实验等的数据解析。pQuant在定量算法上...

刘超 宋春青... 中国化学会第二届全国质谱分析学术报告会会议摘要集 2015-10-16 中国会议

关键词: 蛋白质组学 / 代谢标记 / 蛋白质定量

下载(58)| 被引(0)

AproPhos:基于AdaBoost方法的蛋白质磷酸化修饰预测系统  CNKI文献

磷酸化是最重要的蛋白质翻译后修饰之一,随着蛋白质磷酸化修饰数据不断积累,利用已有数据进行蛋白质磷酸化修饰位点预测的条件日益成熟。利用修饰位点附近氨基酸性质取代氨基酸种类作为特征,对现有516种氨基酸性质做了...

蔡津津 赵杰煜... 《微电子学与计算机》 2007年07期 期刊

关键词: 磷酸化 / 预测 / 氨基酸性质 / AdaBoost

下载(143)| 被引(3)

基于ConA富集和LTQ-FT质谱鉴定的小鼠肝脏内质网N-糖蛋白质...  CNKI文献

糖基化修饰是生物体内复杂和重要的蛋白质翻译后修饰方式之一.N-糖基化蛋白质在内质网中进行合成的过程中,所有的N-糖链都以甘露糖和葡萄糖结尾,而凝集素ConA对以甘露糖结尾的糖链有较高的亲和性,可以用来富集在内质网...

宋丽娜 王京兰... 《中国科学:化学》 2010年05期 期刊

关键词: 糖基化修饰 / 粗面内质网 / 凝集素亲和层析 / ConA

下载(266)| 被引(1)

pPre_ITMS:基于机器学习方法的串联质谱数据预处理系统  CNKI文献

串联质谱技术被广泛应用于高通量的蛋白质鉴定。质谱中噪音峰和同位素峰的存在会降低蛋白质鉴定的准确性,同时增加计算负担。pPre_ITMS系统是针对离子阱数据,利用机器学习中的最大期望方法和决策树方法分别识别出质谱...

邹翠 付岩... 《计算机工程与设计》 2007年09期 期刊

关键词: 机器学习 / 串联质谱 / 预处理

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