1977年,Sanger及其同事发明出最早的DNA测序技术,1990年开始的人类基因组计划催生了DNA测序技术的自动化.近10多年来,新一代测序技术得到了飞速的发展,测序速度及测序通量的巨大提升使得个人基因组的测序成本急剧下降...
作为生物学的一个新领域,系统生物学的兴起及发展为研究生命活动提供了一个全新的思路和方法,它将各种组学的方法综合起来,通过高通量的实验手段,从转录组、蛋白质组、代谢组等方面多层次、全方位地对生物体内的生命活...
加强儿童健康事业发展,是健康中国建设的重要内容,对于保障和改善民生、提高全民健康素质、实现中华民族伟大复兴的中国梦具有重要意义.首都医科大学附属北京儿童医院是我国创建早、规模最大、集医、教、研、护、防为...
倪鑫 石铁流 《中国科学:生命科学》 2018年09期 期刊
关键词： 首都医科大学附属北京儿童医院 / 儿童健康
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单核苷酸多态性是人类基因组中最丰富的遗传变异。单体型是指位于一条染色体上或某一区域的一组相关联的SNP等位位点,单体型已经成为近年来人类遗传研究的组成部分。人类基因组单体型图(HapMap)计划的目标就是构建人类...
生物医学技术的发展,以及近几年"精准医学"概念的提出,使得人们对疾病的探究越来越多地深入到分子层面.与此同时,医学诊疗也逐渐趋于个性化.作为发病率低、发病机制复杂、治疗难度极大的一类疾病,罕见疾病越...
蛋白质相互作用在生命活动中起着重要的作用.目前已开发出几种实验和计算方法能够得到大规模蛋白质相互作用数据.但是,与传统的实验结果相比,蛋白质相互作用大规模数据中存在着比例较高的假阳性.为了能够充分利用这些...
不同宿主H1N1病毒血凝素蛋白(HA)受体结合位点的变异特征 CNKI文献
2009年全球性爆发的H1N1病毒已经导致213个国家和地区受到感染,有16 226人死亡。病毒与宿主细胞表面受体的结合是病毒感染不可缺少的第一步,从而导致病毒膜与宿主细胞膜的融合。血凝素(Hemagglutinin,HA)就是介导这种...
1995年,在四川局部地区爆发的人感染猪链球菌疫情导致200多人感染,30多人死亡.为了研究猪链球菌的致病机理,以达到防止细菌传播和人畜感染的目的,对已测序的猪链球菌(Streptococcussuis)的2个菌株(P1/7,89-1591)进行了...
关键词： 猪链球菌(Streptococcus / suis) / 菌株P1/7 / 菌株89-1591
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计算方法在蛋白质相互作用研究的各个阶段扮演了一个重要的角色。对此,作者将从以下几个方面对计算方法在蛋白质相互作用及相互作用网络研究中的应用做一个概述:蛋白质相互作用数据库及其发展;数据挖掘方法在蛋白质相...
关键词： 蛋白质相互作用数据库 / 蛋白质功能预测 / 蛋白质相互作用网络 / 蛋白质间相互作用
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病毒3CL蛋白酶三维结构模型及其抑制剂的虚拟筛选(英文) CNKI文献
目的:构建SARS病毒类3C(3CL)蛋白酶的三维结构模型,根据这一模型设计3CL蛋白酶的抑制剂。方法:用生物信息学方法从GenBank和PDB库中搜寻出具有晶体结构并与SARS病毒3CL蛋白酶有较高同源型的蛋白质,以此为模板,用同源蛋...
熊斌 桂春山... 《Acta Pharmacologica Sinica》 2003年06期 期刊
关键词： 非典型肺炎(SARS) / 3CL蛋白酶 / 抑制剂 / 分子模拟
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生物技术的迅猛发展推动了生命科学进入大数据时代,以新一代测序技术为代表的高通量生物技术加速了生物学与计算、信息等学科的融合,大大推进了生物信息学的发展.据美国国家生物技术信息中心(National Center for Bio...
中国28个民族群体Y染色体DYS287位点的遗传多态性 CNKI文献
目的研究我国9个省28个民族群体Y染色体DYS287位点的遗传多态性。方法应用Touchdown PCR技术扩增1006个DNA样品的Y染色体Alu序列多态性(YAP)+片断,琼脂糖凝胶电泳分离检测。结果藏族YAP+频率为36·7%,土族23·...
陈阳 褚嘉祐... 《中国医学科学院学报》 2006年02期 期刊
关键词： Y染色体 / Y染色体Alu序列多态性 / 遗传多态性
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从已知的蛋白质序列数据出发,预测蛋白质的功能是生物信息学研究的一项重要任务.常见而有效的一种方法是将蛋白质按照其序列特征归并到不同的功能类中去.据此应用最大似然估计(MLE)算法,我们发展了一种以蛋白质结构域...
在基因表达数据中寻找重要双聚簇的难度随数据规模的增长而增长.该文讨论一种智能化的双聚类方法,充分利用禁忌搜索和遗传算法自身的爬山能力,很好地平衡了区域搜索和全局搜索的关系,并使输出结果不依赖于预先设定的阐...
问号钩端螺旋体是一种致病菌,能够引起人畜共患病．该细菌全基因组序列测序的完成,为从全蛋白质组学的角度分析蛋白质相互作用网络提供了基础．本研究通过整合4种计算方法(基因融合法、基因邻居法、系统发生谱法和操纵...
目的以建立普米族、独龙族和怒族永生细胞为基础,探讨EB病毒转化细胞、细胞培养、冻存、复苏以及支原体检测等建立永生细胞株的技术要点及质量检测方法。方法采用EB病毒转化技术建立3个民族永生细胞株;培养法和PCR法对...
全基因组测序的快速发展在获得大量序列信息的同时也迫切需要获取功能信息,用生物信息学方法进行大规模蛋白质功能预测在这种需求中获得发展。这些预测方法从基于序列同源性发展到基于genomic -context获得功能相关蛋...
关键词： 功能预测 / genomic-context / 网络
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SARS病毒小信封蛋白E:克隆、表达、纯化、CD测定和生物信息... CNKI文献
目的:获得SARS冠状病毒小信封蛋白E(E蛋白),研究其性质,分析其可能的功能。方法:用PCR方法构建了E蛋白的质粒,在大肠杆菌中表达蛋白,用圆二色谱(CD)测定蛋白质的二级结构,用生物信息学方法预测蛋白质的二级结构和可能...
沈旭 薛建华... 《Acta Pharmacologica Sinica》 2003年06期 期刊
关键词： 非典型肺炎(SARS) / 小信封蛋白 / 基因表达 / 生物信息学
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糖尿病分一型糖尿病和二型糖尿病。其中一型糖尿病多发生于青少年,其胰岛素分泌缺乏,必须依赖胰岛素治疗维持生命。二型糖尿病多见于30岁以后中、老年人,其胰岛素的分泌最并不低甚至还偏高。研究发现胰岛素抵抗普遍存...
