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规模化蛋白质鉴定中母离子的准确检测技术研究 CNKI文献
蛋白质组学的基础研究之一是蛋白质鉴定.规模化的蛋白质鉴定通常采用"鸟枪法",即选择一些酶切肽段(母离子)碎裂生成二级谱图,通过二级谱图及其母离子质量鉴定肽段,再推断对应的蛋白质.在鉴定过程中,母离子质...
袁作飞 邬龙... 《生物化学与生物物理进展》 2013年01期 期刊
关键词: 蛋白质组学 / 蛋白质鉴定 / 母离子 / 单同位素峰
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蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组 CNKI文献
随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因...
张昆 王乐珩... 《生物化学与生物物理进展》 2013年04期 期刊
关键词: 蛋白质基因组学 / 基因组注释 / 蛋白质组学 / 质谱技术
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肽段反相色谱保留时间预测算法及其在蛋白质鉴定中的应用 CNKI文献
液相色谱-质谱(LC-MS)联用是当今规模化蛋白质鉴定的主流技术。肽段在反相液相色谱(RPLC)中的保留时间主要是由肽段的理化性质和LC条件(固定相、流动相)决定的。可以通过分析肽段的理化性质,并量化它们对肽段色谱行为...
刘超 王海鹏... 《色谱》 2010年06期 期刊
关键词: 反相液相色谱-质谱联用 / 保留系数 / 机器学习 / 保留时间
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pQuant:蛋白质组学定量数据解析软件 CNKI文献
蛋白质定量是蛋白质组学的重要研究内容,而定量数据解析是其中最关键的环节之一。我们开发了相关软件pQuant,主要支持基于一级谱图信息的标记定量实验,如SILAC标记实验、15N标记实验等的数据解析。pQuant在定量算法上...
刘超 宋春青... 中国化学会第二届全国质谱分析学术报告会会议摘要集 2015-10-16 中国会议
关键词: 蛋白质组学 / 代谢标记 / 蛋白质定量
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pParse:蛋白质组学质谱数据深度解析中的母离子快速灵敏检测 CNKI文献
基于质谱数据的蛋白质鉴定已经成为蛋白质组学中的基础技术[1],而母离子检测是深度解析鸟枪法蛋白质组学质谱数据的第一步。针对这个问题,我们在2012年开发了可以校准母离子的同位素峰[2],并导出共洗脱母离子[3]的质谱...
涂慧君 邬龙... 中国化学会第二届全国质谱分析学术报告会会议摘要集 2015-10-16 中国会议
关键词: 蛋白质组学 / 串联质谱 / 母离子质量校准 / 共洗脱母离子
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